编辑:[db:作者] 时间:2024-08-25 03:20:12
特点
集身分歧特色与模型,可自由组合
对付扩展系统,PWMLFF假设系统的总能量是系统中每个原子能量的总和。PWMLFF用不同的局域原子描述符(即所谓“特色”)来描述局部原子构造,以这些特色作为回归模型的输入,拟合原子能量。PWMLFF支持的回归模型包括线性模型、神经网络(NN)模型和深度势能(Deep Potential)模型。PWMLFF包含了8种常用特色,用户可以将它们与几种模型任意组合利用。
Energy Decomposition
PWMLFF另一个独特功能是可以结合PWmat分子动力学打算中的能量分解功能,将局域的原子能量作为输入。由于局域原子能量可以直接作为数据输入回归模型,这可以显著减少演习所需的分子动力学步数,因此可以战胜机器学习力场须要永劫光预运算来产生演习数据这一困难。在PWMLFF中,总能量、局域原子能量和原子受力均可以作为演习标签输入。
Kalman Filter优化器加速演习
PWMLFF 支持常用优化器Adam以及扩展Kalman滤波优化器(EKF),这是一种演习收敛速率比Adam等优化器更快的一阶梯度优化器,然而每每须要占用更多的内存/显存。龙讯旷腾团队创造性得采取了分层打算的办法(RLEKF,
https://ojs.aaai.org/index.php/AAAI/article/view/25957),利用块对角矩阵来近似稠密加权偏差协方差矩阵,办理了此类优化器在打算中显存占用太多的问题。实验证明,RLEKF演习办法比较于Adam优化器精度更高,速率更快。
大略易上手的操作界面
PWMLFF 供应了从源码安装、离线安装两种办法供用户选择。此外,对付Mcloud用户,我们在Mcloud集成了PWMLFF的所有软件包,实现了“一条命令”即可加载。针对繁芜的演习输入,PWMLFF采取了常见的JSON文件配置办法,并尽可能精简用户输入参数。用户只需类似如下例所示的大略配置,即可实现大多数模型演习。
PWMLFF 输入示例
{
"model_type": "DP",
"atom_type": [14],
"datasets_path": ["./PWdata"]
}
PWMLFF分子动力学接口PWMLFF供应了与分子动力学打算软件lammps的无缝集成接口,支持常见的NVE、NVT、NPT等多种系综设置。该接口不仅支持常规的CPU打算,还实现了GPU多卡加速能力,能高效利用多块GPU卡进行大规模并行加速。此外,调用PWMLFF模型的操作办法也更通用(如下lammps输入文件所示)。
PWact主动学习平台(支持 pip install pwact)
由于机器学习方法的插值特性,对付演习集之外的相空间,MLFF 很难做出准确预测。演习数据常日是利用昂贵的第一性事理打算天生的,现实中很难获取到大量的从头算数据集,天生具有足够代表性的演习数据但不依赖大量从头算数据,对付提升模型的外推能力至关主要。
主动学习的一样平常性流程包括演习、构型探索以及标注。首先,演习模块做力场演习;之后探索模块调用力场模型做分子动力学仿照,仿照结束后把得到的分子运动轨迹送入查询器做不愿定性度量;查询完成后,把待标注构型点送入标注模块;末了标注模块做自洽打算,得到能量和力作为标签,加入已标注数据库中;重复上述步骤,直到收敛。
PWact是开源的基于 PWMLFF 的一套自动化主动学习平台,用于高效的自动化主动学习采样,快速制备PWMLFF力场演习数据。PWact安装和操作大略易学,支持源码安装和更加便捷的pip 命令(pip install pwact)安装两种办法,利用JSON文件作为输入掌握。PWact包括初始演习数据制备以及主动学习两大功能。通过大略的JSON文件配置,即可实现初始演习数据制备和主动学习过程中的打算任务天生、调度、监控、故障规复以及结果网络自动化。支持PWmat、VASP、CP2K、DFTB(PWmat集成,)等常用第一性事理程序。
构造转换工具PWdata(支持 pip install pwdata)
PWdata是一款数据转换工具,能够快捷地实现PWmat、VASP、CP2K之间的构造格式互转,支持各种构造到PWMLFF力场数据格式转换。PWdata支持源码安装和pip命令安装(pip install pwdata)两种办法,简便易用。
演习数据集仓库AIMD数据的高昂制备本钱一贯是限定机器学习力场的瓶颈之一,我们在该数据仓库中上传了常见体系的AIMD 数据集、一些已演习的PWMLFF 模型、常用的不同版本模型转换脚本。便于用户快速复用已有数据集和模型或进行不同模型之间的横向比较,帮助用户节省数据制备和模型演习本钱。
干系下载请前往:https://www.pwmat.com/mlff
END
北京龙讯旷腾科技有限公司是成立于2015年的国家高新技能企业,是海内材料打算仿照工具软件研发创新的领导者,致力于开拓知足“工业4.0”所需的原子精度材料研发Q-CAD(quantum-computer aided design)软件。公司自主开拓的量子材料打算软件PWmat可以进行电子构造打算和从头算分子动力学仿照,适用于晶体、毛病体系、半导系统统、金属体系、纳米体系、量子点、团簇和分子体系等。
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